Travail distanciel 2 : vendredi 13/03 + semaine du 16/03 au 20/03

Unix

Finir les exercices du tutoriel de script bash de la séance 4 :

• Écrire et exécuter le dernier script V3 (version avec l’option --array) de l’exercice 1 sur le cluster.

• Écrire et exécuter le script de l’exercice 2 sur le cluster.

Pour ces deux scripts, vérifier l’exécution des jobs. Pour chaque job, vous indiquerez sur Moodle le numéro du job, le temps total écoulé (Elapsed) et le temps CPU cumulé (CPUTime). La commande suivante pourra vous être utile :

sacct -j <job-id> --format="JobID,JobName,AllocCPU,State,Elapsed,CPUTime"

où <job-id> est le numéro du job.

Python

Un peu de travail pour la prochaine séance

• Refaire le TP sur Jupyter
• Exo 5.4.12 Parcours de demi-matrice sans la diagonale
• Exo 6.7.9 (méthode 2) Détermination des nombres premiers inférieurs à 100
• Exo 8.7.9 Détermination du nombre pi par la méthode Monte-Carlo ; si vous vous sentez capable, vous pouvez essayer de faire l’exercice dans un notebook jupyter et de faire un plot inspiré de la page Wikipedia sur le Monte-Carlo : les points dans le cercle en rouge, les points or du cercle en bleu. Vous pouvez utiliser pour cela la fonction plt.scatter(x, y). Cette fonction dessine un nuage de points dans un graphe, par exemple :

import matplotlib.pyplot as plt

x = [1, 3, 4, 4, 7, 8, 2, 5, 7, 2]
y = [8, 9, 1, 2, 9, 4, 2, 2, 2, 8]

plt.scatter(x,y)
plt.show() # inutile dans un notebook, obligatoire dans un script lancé dans un shell

• Lire les chapitres 10 Plus sur les chaînes de caractères et 11 Plus sur les listes
• Faire le QCM d’entraînement

Projet tutoré

1. Vendredi 13 mars: : Travail en distanciel sur votre Plan de Gestion de Données (PGD ou DMP).
   RV à 10:00 pour un tutoriel sur Opidor en visio conférence, voir le mode d’emploi pour vous connecter en visio. Ensuite vous devrez initier une première version de votre PGD. Vous bénéficierez d’un support en ligne sur le canal Slack du DUBii.

2. Semaine du 16 au 20 mars 2020

Produire un tableau décrivant les métadonnées de votre projet tutoré, voir instructions sur la page dédiée DUBii-projet tutoré

Evaluer ensuite la volumétrie totale de chaque jeu de données de votre projet tutoré.

1. Ajouter votre flowchart dans le diaporama de présentation des apprenants en créant une diapo supplémentaire à la suite de votre diapo de présentation