Bibliographie / webographie

• Article : Five reasons why researchers should learn to love the command line, Jeffrey Perkel, Nature (Technology feature), 2021. Le dépôt GitHub associé avec des exemples de scripts.
• Livre : Bioinformatics Data Skills, Vince Buffalo, O’Reilly Media, 2015.
• Article : A Quick Guide to Organizing Computational Biology Projects, Noble, PLOS Comput Biol, 2009.
• Article : Good enough practices in scientific computing, Wilson et al., PLOS Comput Biol, 2017.
• Mémo : A Critical Guide to Unix, Attwood, F1000 Research, 2018.
• Site internet : The UNIX Shell, cours en ligne de Software Carpentry.
• Site internet : Unix Fondamentals, du Swiss Institute of Bioinformatics.
• Site internet : ShellCheck, pour détecter les éventuels problèmes de syntaxe dans vos scripts.
• Site internet : Rosetta Stone of Workload Managers. Équivalences entre les commandes des différents gestionnaires de cluster (Slurm, PBS, SGE…).