Module Python du Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative
Ouvrez une session sur le Jupyter Hub de l’IFB.
Ouvrez ensuite un terminal Bash.
Dans votre répertoire personnel, créez le répertoire module-2-analyse-visu
puis déplacez-vous dans ce répertoire.
Téléchargez les fichiers nécessaires pour le projet en exécutant les 3 instructions Bash ci-dessous :
wget https://raw.githubusercontent.com/DU-Bii/module-2-Python/master/evaluations/analyse_visu/analyse-visu.ipynb
wget https://raw.githubusercontent.com/DU-Bii/module-2-Python/master/evaluations/analyse_visu/hubert.txt
wget https://raw.githubusercontent.com/DU-Bii/module-2-Python/master/evaluations/analyse_visu/benoist.txt
Vérifiez que vous avez les 3 fichiers suivants dans votre répertoire :
analyse-visu.ipynb
benoist.txt
hubert.txt
Renommer ensuite le notebooks analyse-visu.ipynb
en analyse-visu-<votre-login>.ipynb
où <votre-login>
est votre login sur le cluster.
Dans l’interface Jupyter Lab, ouvrez enfin le notebook analyse-visu-<votre-login>.ipynb
.
Suivez les instructions et complétez le notebook.
Vous déposerez votre notebook au format .ipynb
et .html
(menu File -> Export Notebook As -> Export Notebook to HTML) via ce questionnaire.