Module 2 - Bases de programmation Python

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Module Python du Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative

View the Project on GitHub DU-Bii/module-2-Python

Notebook Jupyter “Analyse et visualisation de données”

Ouvrez une session sur le Jupyter Hub de l’IFB.

Ouvrez ensuite un terminal Bash.

Dans votre répertoire personnel, créez le répertoire module-2-analyse-visu puis déplacez-vous dans ce répertoire.

Téléchargement et préparation des fichiers

Téléchargez les fichiers nécessaires pour le projet en exécutant les 3 instructions Bash ci-dessous :

wget https://raw.githubusercontent.com/DU-Bii/module-2-Python/master/evaluations/analyse_visu/analyse-visu.ipynb
wget https://raw.githubusercontent.com/DU-Bii/module-2-Python/master/evaluations/analyse_visu/hubert.txt
wget https://raw.githubusercontent.com/DU-Bii/module-2-Python/master/evaluations/analyse_visu/benoist.txt

Vérifiez que vous avez les 3 fichiers suivants dans votre répertoire :

analyse-visu.ipynb
benoist.txt
hubert.txt

Renommer ensuite le notebooks analyse-visu.ipynb en analyse-visu-<votre-login>.ipynb<votre-login> est votre login sur le cluster.

Analyse et visualisation de données avec Python

Dans l’interface Jupyter Lab, ouvrez enfin le notebook analyse-visu-<votre-login>.ipynb.

Suivez les instructions et complétez le notebook.

Rendu

Vous déposerez votre notebook au format .ipynb et .html (menu File -> Export Notebook As -> Export Notebook to HTML) via ce questionnaire.