Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative (DUBii)

Description

L’appropriation par des biologistes des méthodes et outils de biostatistique et bioinformatique intégrative est un enjeu majeur pour la montée en compétence des équipes de recherche et des plateformes de service. Le DU en bioinformatique intégrative s’adresse en priorité à des biologistes en demande d’évolution ou de reconversion professionnelle. Ce DU fournit une formation théorique et pratique, complétée par une période d’immersion sur une des plateformes régionales de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), dans le cadre d’un projet tutoré.

Modules d’enseignement

#	Module
0	Activités préparatoires et prérequis
1	Environnement Unix
2	Programmation Python
3	Analyse statistique avec R
4 & 5	Production de données, Méthodes et Outils bioinformatiques pour l’analyse des données à haut débit
6	Bioinformatique intégrative
7	Projet tutoré sur plateforme IFB

Liens utiles et ressources

Contenu	Description	Localisation
Git pages	Supports de cours	https://du-bii.github.io/accueil/
Slack	forum pour échanges et discussions	https://dubii.slack.com
IFB core cluster	Calculs intensifs (accès ligne de commande)	ssh [login]@core.cluster.france-bioinformatique.fr
Serveur Jupyter Hub IFB	Python et plus encore	https://jupyterhub.cluster.france-bioinformatique.fr/
Serveur RStudio IFB	Stat et R	https://rstudio.cluster.france-bioinformatique.fr/
Support communautaire IFB	Support par les ingé IFB + entraide et échanges d’expériences entre usagers	https://support.cluster.france-bioinformatique.fr/

Licence

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