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Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative (DU-Bii)

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Diplôme Universitaire en Bioinformatique Intégrative (DUBii)

Description

L’appropriation par des biologistes des méthodes et outils de biostatistique et bioinformatique intégrative est un enjeu majeur pour la montée en compétence des équipes de recherche et des plateformes de service. Le DU en bioinformatique intégrative s’adresse en priorité à des biologistes en demande d’évolution ou de reconversion professionnelle. Ce DU fournit une formation théorique et pratique, complétée par une période d’immersion sur une des plateformes régionales de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), dans le cadre d’un projet tutoré.

Modules d’enseignement

# Module
0 Activités préparatoires et prérequis
1 Environnement Unix
2 Python
3 Analyse statistique avec R
4 Production des données à haut débit et sources de données pour la biologie intégrative
5 Méthodes et outils bioinformatiques pour l’analyse des données à haut débit
6 Bioinformatique intégrative
7 Projet tutoré sur plateforme IFB

Travail distanciel

Liens utiles

Contenu Description Localisation
Git pages Supports de cours, versions, backups https://du-bii.github.io/accueil/
Planning 2020 Planning synthétique [pdf] [png]
  Planning détaillé [pdf] [png]
Slack forum pour échanges immédiats, pas d’archivage https://dubii.slack.com
Moodle Communications officielles, rapports de travaux personnels, tests, … https://moodlesupd.script.univ-paris-diderot.fr
Ordinateurs locaux Premiers TP, visualisation (IGV), analyse de réseaux (CytoScape) Université de Paris, salles Lamarck A 525 puis B 281, 35 rue Hélène Brion
IFB core cluster Calculs intensifs (accès ligne de commande) ssh [login]@core.cluster.france-bioinformatique.fr
Serveur RStudio IFB Stat pour la bioinfo + tutorat si affinités https://rstudio.cluster.france-bioinformatique.fr/
Support communautaire IFB Support par les ingé IFB + entraide et échanges d’expériences entre usagers https://support.cluster.france-bioinformatique.fr/
Apprenants Trombinoscope apprenants https://tinyurl.com/dubii20-apprenants
Intervenants Trombinoscope des intervenants https://tinyurl.com/dubi20-intervenants

Licence

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